Поликлиника ЮОМЦ имеет следующие подразделения: терапевтическое отделение, детская консультация, женская консультация, дерматовенерологическое отделение, неврологическое отделение, хирургическое отделение, хирургический кабинет, урологический кабинет, офтальмологический кабинет, отоларингологический кабинет, отделение функциональной диагностики, клинико-диагностическая лаборатория, отделение лучевой диагностики.