Городская клиническая больница №25 города Новосибирска была основана в 1950 году для лечения и реабилитации работников атомной промышленности и энергетики, изначально носила название Центральная медико-санитарная часть №25. 13 марта 1998 года, в связи с полной реорганизацией учреждений управления здравоохранения Новосибирска, больница стала называться Муниципальная клиническая больница № 25 и лишь 13 декабря 2002 учреждение было переименовано в городскую клиническую больницу №25.

В городской клинической больнице №25 работают 14 кандидатов медицинских наук, 1 доктор медицинских наук, 152 врачей высшей и первой категории. На базе стационара больницы осуществляют научный и учебный процесс некоторые кафедры медицинского университета и медицинского колледжа.